正伦被贬为横州刺史，李义府被贬为普州刺史。杜正伦不久后死于横州。
阿史那贺鲁被擒后，对萧嗣业说：“我本是亡国俘虏，被先帝收留，先帝待我优厚而我背叛了他，今日失败，是上天发怒。我听说中国处决犯人必定在集市，希望在昭陵前处死我，以谢先帝。”皇帝听说后怜悯他。
贺鲁被押到京师，甲午日，在昭陵献俘。皇帝下令赦免他的死罪，将他的部落分为六个都督府，他所统辖的各国都设置州府，西到波斯，都隶属于安西都护府。贺鲁不久后去世，葬在颉利可汗墓旁。
戊戌日，任命许敬宗为中书令，大理卿辛茂将为兼任侍中。
开府仪同三司鄂忠武公尉迟敬德去世。敬德晚年闲居，学习延年益寿之术，修整池台，演奏清商乐自我娱乐，不与宾客交往，共十六年。享年七十四岁，病逝，朝廷给予的恩宠礼仪非常优厚。
这一年，爱州刺史褚遂良去世。
雍州司士许祎与来济交好，侍御史张伦与李义府有仇，吏部尚书唐临上奏任命许祎为江南道巡察使，张伦为剑南道巡察使。当时李义府虽在外地，皇后常保护他，于是指控唐临挟私任命官员。
显庆四年，公元659年，春季二月乙丑日，朝廷罢免了唐临的官职。
三月壬午日，西突厥兴昔亡可汗（阿史那弥射）与真珠叶护在双河交战，斩杀了真珠叶护。
夏季四月丙辰日，任命于志宁为太子太师、同中书门下三品；乙丑日，任命黄门侍郎许圉师为参知政事。
武后因太尉赵公长孙无忌接受重赏却不支持自己，对他深怀怨恨；当初商议废王皇后时，燕公于志宁保持中立不表态，武后也不高兴。许敬宗多次以利害劝说长孙无忌，长孙无忌常当面驳斥他，许敬宗也心生怨恨。武后册立后，长孙无忌内心不安，武后便让许敬宗找机会陷害他。
恰逢洛阳人李奉节告发太子洗马韦季方、监察御史李巢结党，皇帝命许敬宗与辛茂将审讯。许敬宗逼供甚急，韦季方自杀未遂，许敬宗趁机诬告：“韦季方想与长孙无忌勾结，陷害忠臣近戚，让权力归长孙无忌，伺机谋反，事败后自杀。”
皇帝震惊：“哪会有这种事！舅舅被小人离间，心生猜疑是有的，何至于谋反！”许敬宗说：“我彻底追查后，谋反迹象已露，陛下若还怀疑，恐怕不是国家之福。”皇帝哭道：“我家不幸，亲戚屡怀异心，往年高阳公主与房遗爱谋反，现在元舅又这样，让我没脸见天下人。这事若是真的，该怎么办？”
许敬宗答：“房遗爱是乳臭小儿，和女子谋反，成不了事！长孙无忌与先帝夺取天下，天下服其智谋；做宰相三十年，天下畏其权威；若他突然作乱，陛下能派谁抵挡？如今靠宗庙之灵、上天憎恶奸邪，借小事查出大奸，实在是天下之幸。我怕长孙无忌得知韦季方自杀，狗急跳墙，振臂一呼，同党云集，必成宗庙之患。从前宇文化及的父亲宇文述受隋炀帝亲信，联姻掌权；宇文述死后，宇文化及掌管禁兵，一夜在江都作乱，先杀异己，我家也遭其祸，大臣苏威、裴矩等人都向他叩拜，唯恐不及，黎明就颠覆了隋朝。前事不远，愿陛下速做决断！”
皇帝命许敬宗再审查。次日，许敬宗复奏：“昨夜韦季方已承认与长孙无忌同反，我问他‘长孙无忌是国舅，历代受宠，为何谋反？’韦季方说：‘韩瑗曾对长孙无忌说：“柳奭、褚遂良劝您立梁王为太子，如今梁王被废，皇上也怀疑您，所以外放高履行。”从此长孙无忌忧惧，渐谋自保。后来见长孙祥外放、韩瑗获罪，便日夜与韦季方等谋反。’我验证供词，都相符合，请收捕按法处置。”
皇帝又哭：“舅舅若真如此，我绝不忍心杀他；若杀了，天下、后世会怎么说我！”许敬宗说：“薄昭是汉文帝的舅舅，文帝从代国来，薄昭有功，仅因杀人获罪，文帝派百官穿丧服哭着杀了他，至今天下称文帝为明主。长孙无忌忘两朝大恩，图谋颠覆社稷，罪比薄昭重得多。幸好奸情自露、逆党认罪，陛下还犹豫什么？古人说‘当断不断，反受其乱’，安危关头不容迟疑。长孙无忌是当今奸雄，像王莽、司马懿之流；陛下再拖延，我怕祸起身边，悔之晚矣！”皇帝认可，竟不召见长孙无忌对质。
戊辰日，下诏削去长孙无忌的太尉官职及封邑，改任扬州都督，安置在黔州，按一品待遇供给。长孙祥是长孙无忌的堂侄，此前从工部尚书外放荆州长史，许敬宗便借此诬陷他。
许敬宗又奏：“长孙无忌谋反，是褚遂良、柳奭、韩瑗煽动而成；柳奭还暗中勾结宫掖，图谋下毒，于志宁也党附长孙无忌。”于是下诏追削褚遂良官爵，削除柳奭、韩瑗官籍，罢免于志宁官职。朝廷派使者征调沿途兵力押送长孙无忌去黔州，长孙无忌之子秘书监驸马都尉长孙冲等都被削籍，流放岭南；褚遂良之子彦甫、彦冲流放爱州，途中被处死；益州长史高履行多次被贬，最终任洪州都督。
五月丙申日，兵部尚书任雅相、度支尚书卢承庆一同担任参知政事。卢承庆是卢思道的孙子。
凉州刺史赵持满，力大善射、喜好侠义，他的姨母是韩瑗的妻子，舅舅驸马都尉长孙铨是长孙无忌的族弟，长孙铨因长孙无