理车骑将军的职位，让他带着越骑校尉冯柱、代理度辽将军朱徽，领着左右羽林军、北军五校的士兵，还有各郡国擅长射箭的人、边疆的守兵，同时让乌桓校尉任尚带着乌桓、鲜卑的军队，总共四万人去攻打逢侯。那时候，南单于和中郎将杜崇在牧师城驻守，结果被逢侯带着一万多骑兵给包围了。到了冬天十一月，邓鸿他们的军队就赶到了美稷这个地方，逢侯一看形势不妙，就撤了围，并往满夷谷跑去。南单于就派自己的儿子带着一万骑兵，再加上杜崇的四千骑兵，跟邓鸿他们一起追击逢侯，一直追到大城塞，最终杀了四千多叛军。任尚则是带着鲜卑、乌桓的军队在满夷谷拦住了逢侯，又把逢侯打得大败。这几仗打下来，一共杀了一万七千多叛军。最后逢侯带着剩下的残兵败将逃到塞外去了，汉军眼看追不上了，就收兵回去了。
大司农陈宠被朝廷任命为廷尉，负责司法审判工作。陈宠这人天性善良宽厚，在审理那些复杂难断的案子时，经常引用古代经典里的道理，尽量从轻发落。在他的努力下，之前司法审判中那种严厉苛刻、动不动就重罚的风气好了很多。
此时的皇帝想让江夏人、当时担任尚书令的黄香去当东郡太守，管理地方事务。但黄香拒绝了，他跟皇帝说：“我真不擅长管理一郡之地、处理地方政务，还是希望您能让我留在朝廷，给我个不太忙的闲职，或者安排个能监督、责罚小事情的职位就行，让我留在宫里处理些琐碎的工作。”皇帝看黄香这么诚恳，就答应了他的请求，让他继续当尚书令，还给他涨了工资，提到了二千石的级别，对他是越发亲近、看重了。黄香也没辜负皇帝的信任，工作特别努力，对待公事就像操持自家家务一样上心。
公元95年春天正月，邓鸿等人带着讨伐叛军的军队回朝了，冯柱则是率领虎牙营留在五原驻守。邓鸿因为行军时磨磨蹭蹭、耽误了战机，回来就被关进了监狱，最后被处死。后来皇帝发现，朱徽和杜崇不仅没能跟胡人搞好关系，还拦着胡人不让他们向朝廷上书沟通，这才导致胡人反叛，于是就把朱徽和杜崇召回，也关进监狱处死了。
夏天四月，天空出现日食现象。
秋天七月，易阳这个地方的地面裂开了。
九月，京城发生了地震。
乐成王刘党因为杀了人，所以被削去东光、鄡这两个县的封地。
公元96年春天二月，皇帝把贵人阴氏立为皇后，阴皇后是阴识的曾孙女。
夏天四月，乐成靖王刘党去世。他的儿子哀王刘崇继承王位，但没过多久也死了，而且没留下子嗣，于是乐成国的封国就被废除了。
五月，河内和陈留这两个地方闹起了蝗灾，蝗虫把庄稼都祸害了，老百姓又没了收成，要饿肚子了。
此时的南匈奴右温禺犊王乌居战反叛了，带人逃出了边塞。 秋天七月 ，度辽将军庞奋和越骑校尉冯柱就带兵前去追击，最终打败了乌居战，还把乌居战剩下的人马以及投降的两万多胡人，都迁移到安定和北地这两个地方。
随后，东师后部王涿鞮发动叛乱，带兵去攻打东师前王尉毕大，还抓走了尉毕大的老婆孩子。
九月，京城又闹起了蝗灾。
冬天十月，北海王刘威被查出不是敬王的亲生儿子，还犯了诽谤罪，最后自杀了。
十二月，陈敬王刘羡去世。过了几天，南宫的宣室殿突然着火了。
就在这时，护羌校尉贯友去世了，朝廷就派汉阳太守史充接替他的职位。史充一到任，就马上调动湟中的羌人和胡人，让他们出塞去攻打迷唐。迷唐就带兵迎战，结果把史充的军队打得大败，还杀了几百人。史充因此被朝廷召回，朝廷又派代郡太守吴祉接替他管理羌族事务。
公元97年也发生了不少事。
春天三月的时候，陇西地区发生地震。
到了癸巳日这天，济南安王刘康去世。
西域长史王林攻击车师后王，并斩杀了他。
夏天四月，朝廷就封乐成王刘党之子刘巡为乐成王。
五月，皇帝下诏封皇后的父亲屯骑校尉阴纲为吴防侯，让他以特进的身份退休。
六月，又发生了旱灾和蝗灾。
到了秋天八月，鲜卑侵犯肥如地区，辽东太守祭参因为战败被下狱处死。
闰月辛巳日这天，皇太后窦氏去世了。当初，梁贵人去世后，宫里把相关事情都保密起来，所以没人知道皇帝其实是梁贵人所生的。舞阴公主的儿子梁扈，就派堂兄梁襢给太尉、司徒、司空三府上奏，说：“按照汉朝以往的规矩，皇帝都会尊崇生母一族。梁贵人生下了当今皇帝，却一直没得到应有的尊号，希望朝廷能追封她。”太尉张酺就把这事报告给了皇帝，皇帝知道后特别难过，就问张酺：“你觉得该怎么办？”张酺建议追尊梁贵人为皇太后，并且记录梁氏亲属，给予他们相应的待遇，皇帝同意了。
正好这时候，梁贵人的姐姐、南阳樊调的妻子梁嫕也上书诉说：“我父亲梁竦含冤死在狱中，到现在尸骨都还没下葬；母亲已经七十多岁了，弟弟梁棠他们又被流放到遥远的边疆，现在是死是活都不知道。希望能让我把父亲尸骨安葬了，也让母亲和弟