神龙二年，公元706年，春季正月戊戌日，朝廷任命吏部尚书李峤为同中书门下三品，任命中书侍郎于惟谦为同平章事。
闰正月丙午日，唐中宗下诏：“太平、长安、安乐、宜城、新都、定安、金城七位公主一并开设官署，设置僚属。”
武三思因为敬晖、桓彦范、袁恕己还在京城，心中十分忌惮。乙卯日，武三思将三人外放，分别担任滑州、洺州、豫州刺史。
朝廷赐予閺乡县僧人万回法云公的称号。甲戌日，任命突骑施酋长乌质勒为怀德郡王。
二月乙未日，朝廷任命刑部尚书韦巨源为同中书门下三品，韦巨源还得以与韦皇后叙宗族辈分。丙申日，僧人慧范等九人全部被晋升为五品官阶，赐予郡公或县公的爵位；道士史崇恩等三人被晋升为五品官阶，任命为国子祭酒，待遇与正式官员相同；叶静能被加授金紫光禄大夫。
朝廷挑选左、右御史台及朝廷内外五品以上官员二十人担任十道巡察使，委派他们考核官吏、安抚百姓、举荐贤才、复审案件，每两年轮换一次，根据他们的功过决定升降职位。易州刺史魏县人姜师度、礼部员外郎马怀素、殿中侍御史临漳人源乾曜、监察御史灵昌人卢怀慎、卫尉少卿滏阳人李杰都在此次入选的名单中。
三月甲辰日，中书令韦安石被免去宰相职务，改任户部尚书；户部尚书苏瑰被任命为侍中、西京留守。苏瑰是苏颋的父亲。唐休璟辞官退休。
当初，少府监丞弘农人宋之问和他的弟弟兖州司仓宋之逊，都因依附张易之而被贬到岭南，后来两人逃回东都，藏在友人光禄卿、驸马都尉王同皎家中。王同皎痛恨武三思和韦后的所作所为，每次和亲信谈论起他们，总是咬牙切齿。宋之逊在门帘后听到这些话，便秘密派他的儿子宋昙和外甥校书郎李悛去告密，想要借此赎罪。武三思让宋昙、李悛以及抚州司仓冉祖雍上书，诬告王同皎和洛阳人张仲之、祖延庆、武当县丞寿春人周憬等人暗中勾结壮士，计划刺杀武三思，随后率兵闯入皇宫，废黜韦皇后。唐中宗下令御史大夫李承嘉、监察御史姚绍之审理此案，又命杨再思、李峤、韦巨源参与核验。张仲之当庭揭发武三思的罪状，事情牵连到后宫。杨再思、韦巨源假装打瞌睡，不予理会；李峤和姚绍之下令将张仲之反绑双手，押入监狱。张仲之回头不停控诉，姚绍之命人用棍棒击打他，打断了他的手臂。张仲之大声呼喊：“我已经输给你了，死了之后必定到上天那里控告你！”庚戌日，王同皎等人都被判斩首，家产被官府没收。周憬逃到比干庙中，高声大喊：“比干是古代的忠臣，应当知道我的忠心！武三思与皇后淫乱，危害国家，很快就会被斩首示众，我只恨不能亲眼看到这一天！”于是自刎而死。宋之问、宋之逊、宋昙、李悛、冉祖雍都被任命为京官，晋升为朝散大夫。
武三思与韦后日夜不停地在唐中宗面前诬陷敬晖等人，唐中宗又将敬晖降职为朗州刺史，崔玄暐降职为均州刺史，桓彦范降职为亳州刺史，袁恕己降职为郢州刺史；与敬晖等人一同立功的谢思行等人，都被视为同党，受到贬谪。
朝廷大量增置员外官，从京城各部门到各州，一共增设两千多人；宦官被破格提拔为七品以上员外官的，又将近一千人。
魏元忠从端州回到京城担任宰相后，不再直言强谏，只是一味迎合世俗，朝廷内外的人都对他感到失望。酸枣县尉袁楚客写信给魏元忠，信中说：“君主刚刚承受天命，应当革新德行，提拔君子，罢黜小人，以此振兴教化，怎么能安于荣华富贵，沉默不言呢！如今不早点册立太子，挑选师傅辅佐他，这是第一个过失。公主开设官署、设置僚属，这是第二个过失。尊崇僧人道士，让他们游走于权贵之门，依仗权势收受贿赂，这是第三个过失。戏子小人窃取官爵俸禄，这是第四个过失。有关部门选拔举荐贤才，全靠钱财和权势打通门路，这是第五个过失。宠爱提拔宦官，人数将近一千，这是酿成祸乱的根源，这是第六个过失。王公贵戚，赏赐毫无节制，竞相奢侈浪费，这是第七个过失。大量增置员外官，耗费钱财、损害百姓，这是第八个过失。前朝宫女，获准出宫居住，出入没有禁令，结交权贵、请托办事，这是第九个过失。旁门左道之人迷惑君主的视听，窃取俸禄官位，这是第十个过失。这十个过失，您不去纠正，还有谁能纠正呢！”魏元忠收到信后，只是惭愧地道歉而已。夏季四月，唐中宗将韦皇后之父韦玄贞的追赠爵位改为酆王，韦皇后的四个弟弟都被追赠为郡王。
己丑日，左散骑常侍、同中书门下三品李怀远辞官退休。
平民京兆人韦月将上书告发武三思暗中与后宫勾结，必定会发动叛乱。唐中宗勃然大怒，下令将韦月将斩首。黄门侍郎宋璟上奏请求审查此案，唐中宗更加愤怒，来不及整理头巾，拖着鞋子从侧门出来，对宋璟说：“我还以为已经把他斩了，竟然还没有执行吗！”下令立刻将韦月将斩首。宋璟说：“有人告发皇后与武三思私通，陛下不加以审问就将告发者处死，我担心天下百姓一定会私下议论。”坚持请求审查此案，唐中宗不允许。宋璟说：“陛下如果一定要斩韦月将，那就请先斩我！否则，我