辛巳日，高开道管辖的弘阳、统汉二镇前来投降。
癸未日，突厥侵犯原州；乙酉日，侵犯朔州。李高迁被敌军击败，行军总管尉迟敬德领兵救援。己亥日，朝廷派遣太子李建成领兵驻守北方边境，秦王李世民驻守并州，防备突厥入侵。八月甲辰日，突厥侵犯真州，又侵犯马邑。
壬子日，淮南道行台仆射辅公祏反叛。当初，杜伏威与辅公祏关系友好，辅公祏年纪稍大，杜伏威把他当作兄长对待，军中称他为伯父，士兵们对他的敬畏与对杜伏威的相同。杜伏威逐渐猜忌辅公祏，于是任命自己的养子阚棱为左将军，王雄诞为右将军，暗中夺取辅公祏的兵权。辅公祏得知后，心中不满，与他的老朋友左游仙假装学道辟谷来掩饰自己的情绪。等到杜伏威入朝，留下辅公祏守卫丹杨，命令王雄诞掌管军队辅佐他，暗中对王雄诞说：“我到长安后，如果没有失去职位，就不要让辅公祏发动变乱。”杜伏威出发后，左游仙劝说辅公祏谋反；但王雄诞掌握兵权，辅公祏无法动手。于是辅公祏谎称收到杜伏威的书信，怀疑王雄诞有二心，王雄诞听说后很不高兴，称病不再处理事务；辅公祏趁机夺取他的兵权，派自己的党羽西门君仪向他说明反叛的计划。王雄诞这才醒悟并后悔，说：“如今天下刚刚平定，吴王又在京城，大唐军队威力无穷，所向无敌，为什么要无故自取灭族之祸呢！我王雄诞只有一死而已，不敢听从你的命令。如今跟随你反叛，不过是延长一百天的性命罢了，大丈夫怎能因为贪图片刻的存活，而使自己陷入不义之地呢！”辅公祏知道无法说服他，就将他缢杀。王雄诞善于安抚士兵，士兵们都愿意为他效死力，而且他治军严明，每次攻破城池，都秋毫无犯。他去世那天，江南军中将士和民间百姓都为他流泪。辅公祏又谎称杜伏威无法返回江南，送来书信命令他起兵，于是大规模修造铠甲兵器，运输粮食储备。不久后在丹杨称帝，国号为宋，修复陈朝的旧宫殿居住。设置文武百官，任命左游仙为兵部尚书、东南道大使、越州总管，与张善安联合兵力，任命张善安为西南道大行台。己未日，突厥侵犯原州。
乙丑日，朝廷下诏令襄州道行台仆射赵郡王李孝恭率领水军赶赴江州，岭南道大使李靖率领交州、广州、泉州、桂州的兵力赶赴宣州，怀州总管黄君汉从谯州、亳州出兵，齐州总管李世积从淮水、泗水出兵，共同讨伐辅公祏。李孝恭即将出发时，与各位将领设宴聚会，下令取水，水忽然变成血红色，在座的人都大惊失色，李孝恭却神色自若，说：“这是辅公祏被斩首的征兆！”一饮而尽，众人都心悦诚服。
丙寅日，吐谷浑归附唐朝。辛未日，突厥攻陷原州的善和镇；癸酉日，又侵犯渭州。高开道率领奚族军队侵犯幽州，州兵击退了他们。
九月丙子日，太子李建成班师回朝。戊子日，辅公祏派遣将领徐绍宗侵犯海州，陈政通侵犯寿阳。邛州獠人反叛，朝廷派遣沛公郑元璹讨伐他们。
庚寅日，突厥侵犯幽州。壬辰日，朝廷下诏任命秦王李世民为江州道行军元帅。
乙未日，窦伏明献出沙州投降唐朝。这时，高昌王麹伯雅去世，他的儿子麹文泰继位。丙申日，渝州人张大智反叛，刺史薛敬仁弃城逃走。壬寅日，高开道率领两万突厥骑兵侵犯幽州。
突厥厌恶弘农公刘世让成为自己的祸患，派遣大臣曹般陁前来，谎称刘世让与颉利可汗勾结，企图作乱，唐高祖相信了这话。冬季，十月丙午日，高祖杀死刘世让，抄没他的家产。
此时，秦王李世民还在并州，己未日，朝廷下诏令李世民率军返回长安。张大智侵犯涪州，刺史田世康等人讨伐他，张大智率领部众投降。
当初，高祖派遣右武候大将军李高迁协助朔州总管高满政守卫马邑，苑君璋率领一万多突厥骑兵抵达城下，被高满政击败。颉利可汗大怒，发动大军攻打马邑。李高迁心生畏惧，率领部下两千人冲破关卡连夜逃跑，突厥军队半路截击，李高迁的军队损失过半。颉利可汗亲自率领大军攻城，高满政出兵抵御，有时一天交战十多个回合。高祖命令行军总管刘世让救援马邑，刘世让到达松子岭后，不敢前进，退守崞城。恰逢颉利可汗派遣使者请求和亲，高祖说：“先解除对马邑的包围，才能商议和亲之事。”颉利可汗想撤兵，义成公主坚决请求继续攻城。颉利可汗知道高开道擅长制造攻城器械，于是召见高开道，与他一起猛攻马邑。颉利可汗引诱高满政投降，遭到高满政的痛骂。马邑城中粮草即将耗尽，救兵迟迟未到，高满政想冲破包围圈逃往朔州，右虞候杜士远认为突厥军队势大，担心难以脱身，壬戌日，杀死高满政后向突厥投降，苑君璋又杀死城中与高满政同谋的三十多名豪杰。高祖任命高满政的儿子高玄积为上柱国，承袭父亲的爵位。丁卯日，突厥再次请求和亲，将马邑归还唐朝；高祖任命将军秦武通为朔州总管。
突厥多次侵扰边境，并州大总管府长史窦静上表请求在太原设置屯田，以节省军粮运输；议事的大臣认为屯田会烦扰百姓，不同意这一建议。窦静反复恳切争辩，高祖下诏征召窦静入朝，让他与裴寂、萧瑀、封德彝在高祖面前辩论，裴寂等人无法说服窦静，高